L'agobiopsia polmonare è necessaria quando occorre un campione di tessuto di una regione polmonare che non può essere raggiunta con il broncoscopio. Si inietta un anestetico locale nella cute che ricopre le coste; successivamente si effettua il prelievo mediante un ago lungo (fig.2) e sottile tra le costole (agobiopsia), sotto la guida radiografica o ecografica (fig.1).
Se è necessario prelevare una quantità maggiore di tessuto si esegue invece una biopsia 'a cielo aperto', procedura effettuata in anestesia generale.